Quando Mothra foi ao espaço sideral para impedir que um meteoro chegasse à Terra, ela acidentalmente levou com células de Godzilla e células restantes de Biollante que habitavam nossa atmosfera. As células combinadas passaram por um buraco negro e criaram uma nova criatura, Space Godzilla. Space Godzilla segue para a Terra para enfrentar Godzilla, Junior Godzilla e o novo robô G-Force, MOGERA.