Materia oscura cuenta la historia de una zona de guerra en tiempos de paz. La ubicación de la película es el campo de pruebas de Salto di Quirra (Cerdeña, Italia) donde, durante más de cincuenta años, los gobiernos de todo el mundo han probado 'nuevas armas' y donde el gobierno italiano ha llevado a cabo explosiones controladas de existencias de armas viejas, poniendo en peligro inexorablemente el territorio. En este contexto, la película comprende tres movimientos.