Materia oscura conta a história de uma zona de guerra em tempos de paz. O local do filme é o campo de testes de Salto di Quirra (Sardenha, Itália) onde, por mais de cinquenta anos, governos de todo o mundo testaram 'novas armas' e onde o governo italiano realizou explosões controladas de antigos estoques de armas, colocando inexoravelmente em perigo o território. Nesse contexto, o filme compreende três movimentos.