Sean Barker divenne l'ospite riluttante di una bioarmatura aliena nota come Guyver. Un anno fa ha distrutto la Kronos Corporation, un'organizzazione di mutanti che vogliono il Guyver. Ora sta cercando di scoprire perché l'unità Guyver lo costringe a combattere e uccidere il male. Viene condotto in un sito archeologico dove gli scienziati scoprono un'antica astronave. Ora deve combattere di nuovo contro Crono prima che scoprano i segreti delle origini del Guyver.