Gli ambientalisti militanti Kate e Joe assistono, e filmano, alla rapida crescita di un gigantesco apparato radicale che inizia letteralmente a falciare il paese come un terremoto. Allo stesso tempo, l'agente governativo Jack Taylor contatta l'esperto di piante Jocelyn Snow, che scopre che il suo ex collega, Frame Marcos, è la probabile fonte dell'antico seme che ha dato il via all'intero disastro ecologico. Sotto la crescente minaccia di enormi tsunami, se l'enorme apparato radicale dovesse rintanarsi sotto l'oceano, Jack, Jocelyn, Joe e Kate affrontano Frame nel suo complesso, quindi tornano al luogo in cui tutto è iniziato, con la speranza che Jocelyn possa disabilitare la radice embrionale e far cessare il disastro.