O jogo se passa após os eventos de BlazBlue: Calamity Trigger. Alguns dias se passaram desde o relatado ataque de Ragna, o Bloodedge. Com o NOL sem oferecer nenhuma explicação oficial, os cidadãos expressam suas próprias teorias, exagerando e espalhando rumores como um incêndio. Completamente indiferente ao estado da cidade, Ragna espera pela chance de atingir seu verdadeiro objetivo, e então, o enorme "poder" que enredou Ragna começa a se ativar.