Em um mundo com uma história alternativa, uma grande guerra finalmente chega ao fim, deixando a Terra doente e poluída. O geneticista Dr. Azuma disputa o apoio do governo para seu tratamento com neocélulas que, segundo ele, pode rejuvenescer o corpo e regenerar a humanidade. Os líderes do governo, guardando seus próprios poderes profundamente arraigados, recusam o professor. Impelido a concluir seu trabalho, Dr. Azuma aceita uma oferta secreta de uma facção sinistra dos poderosos militares. Depois que um incidente ocorre no laboratório do Dr. Azuma, uma raça de humanos mutantes conhecida como Shinzo Ningen é solta no mundo. Agora, apenas o guerreiro conhecido como Casshern, reencarnado com um corpo invencível, está entre o Shinzo Ningen e um mundo à beira da aniquilação.