Baseado no anime cyberpunk de mesmo nome. Os jogos acontecem no ano de 2030, entre as histórias contadas em Kôkaku kidôtai: Stand Alone Complex (2002) e Ghost in the Shell: S.A.C. 2ª GIG. Major Motoko Kusanagi deve descobrir a verdade por trás de um caso misterioso conhecido apenas como T.A.R.