Basato sull'omonimo anime cyberpunk. I giochi si svolgono nell'anno 2030, tra le storie raccontate in Kôkaku kidôtai: Stand Alone Complex (2002) e Ghost in the Shell: S.A.C. 2 ° GIG. Il maggiore Motoko Kusanagi deve scoprire la verità dietro un misterioso caso noto solo come T.A.R.