CSS Hunley conta a incrível história real da tripulação do submarino de propulsão manual CSS Hunley, durante o cerco de Charleston em 1864. É uma história de heroísmo em face da adversidade, sendo o Hunley o primeiro submersível a afundar um barco inimigo em tempo de guerra. Também relata o lado humano da história, relatando o temperamento incomum e extraordinário dos 9 homens que conduziram os Hunley para a história e morreram bravamente realizando esse feito.