Wir schreiben das Jahr 2306. Dreizehn Jahre sind vergangen, seit Captain James T. Kirk vom Nexus weggefegt wurde, nachdem er die Besatzung der USS Enterprise-B gerettet hatte. Die restlichen Besatzungsmitglieder der ursprünglichen USS Enterprise sind getrennte Wege gegangen. Captain Nyota Uhura und Captain Pavel Chekov kommen zusammen mit Captain John Harriman von der Enterprise-B zu einer besonderen Widmung zu Ehren von Kirks Enterprise zusammen. Ihr Wiedersehen wird unterbrochen, als sie einen Notruf von einem mysteriösen Planeten erhalten, der die drei Freunde dazu drängt, sich auf eine Mission zu begeben, die ihr Leben für immer verändern wird.