Zen ist eigentlich ein ernsthaftes Action-/Drama, das in den 1750er Jahren in Japan spielt. Die Geschichte handelt von einem jungen 15-jährigen Samurai-Krieger namens Zen. Er lebt mit seinem Meister Lord Ito und seiner schönen jungen Enkelin Keiko, die ebenfalls 15 ist, zusammen. Zen sieht Keiko als Schwester, aber sie sieht ihn als ihren zukünftigen Ehemann. Dies verursacht ihnen einige Probleme. Gemeinsam lernen die beiden viel über die Beziehungen des Lebens, Liebe, Hass und Vampire.