Poco después del comienzo del nuevo milenio, la observación del espacio profundo llevó a una conclusión escalofriante: la Tierra pronto sería golpeada por un grupo de pequeños asteroides. Desesperado, el país de Erusea desarrolló Stonehenge, un arma balística antiaérea masiva, en el centro del continente de Usea. El arma, en su mayor parte, funcionó. Sin embargo, después de que pasó el peligro, Erusea se dio cuenta de lo poderosa que era un arma. Usando Stonehenge, Erusea estableció la superioridad aérea sobre todo el continente de Usea. Las fuerzas terrestres convencionales no fueron rival para el bombardeo aéreo de la fuerza aérea de Erusea, y las Fuerzas Aliadas de los Estados Independientes (ISAF) se vieron obligadas a retirarse a la isla de North Point, más allá del alcance de Stonehenge. Debilitada y fragmentada, la ISAF se entera de un ataque aéreo final que se llevará a cabo en su cuartel general y revuelve a los pocos pilotos que le quedan para contraatacar. El jugador toma el control de un piloto novato, conocido solo por el indicativo Moebius-1, y toma un papel vital en la ISAF ...