Taken couvre cinq décennies et quatre générations, centrées sur trois familles : les Keys, les Crawford et les Clarke. Le vétéran de la Seconde Guerre mondiale Russell Keys est en proie à des cauchemars de son enlèvement par des extraterrestres pendant la guerre; l'incident de Roswell transforme Owen Crawford d'ambitieux capitaine de l'Air Force en conspirateur du gouvernement de l'ombre maléfique ; la malheureuse mariée Sally Clarke est enceinte d'un visiteur extraterrestre. Au fil des décennies, les héritiers de chacun sont touchés par les machinations des extraterrestres, culminant avec la naissance d'Allie Keys, qui est le produit final de l'expérimentation des extraterrestres et détient la clé de leur avenir.