"Merlin: The Return" est l'histoire de la bataille entre le bien et le mal. Les forces obscures de Mordred s'opposent à la sorcellerie mythique de Merlin. Mordred et sa mère Morgana ont été emprisonnés dans un autre monde au cours des 1500 dernières années tandis que les pouvoirs magiques de Merlin les tenaient à distance. Cependant, dans le présent, un scientifique trouve accidentellement la passerelle vers l'autre monde et est sur le point de libérer Mordred dans la vie du 20e siècle. Arthur est réveillé de son sommeil et, avec Merlin, essaie de trouver un moyen d'empêcher Mordred de revenir dans ce monde.