"Merlin: Dönüş" iyi ve kötü arasındaki savaşın hikayesidir. Mordred'in karanlık güçleri, Merlin'in efsanevi büyüsüyle karşı karşıya. Mordred ve annesi Morgana, Merlin'in büyülü güçleri onları uzak tutarken 1500 yıldır başka bir dünyada hapsedildi. Ancak günümüzde, bir bilim adamı yanlışlıkla diğer dünyaya açılan kapıyı bulur ve Mordred'i 20. yüzyıl yaşamına salmak üzeredir. Arthur uykusundan yeniden uyanır ve Merlin ile birlikte Mordred'in bu dünyaya yeniden girmesini engellemenin bir yolunu bulmaya çalışır.