Un jour, Ratchet, un Lombax (créature jaune ressemblant à un humain), est témoin d'un crash de vaisseau spatial sur sa planète natale de Veldin. Le vaisseau était piloté par Clank, un petit robot, qui s'était échappé de sa planète natale Quartu, peu de temps après sa création, alors qu'il découvrait l'horrible vérité sur les plans diaboliques du président Drek, dont la planète natale est si polluée et inhabitable. qu'il forme un plan astucieux pour extraire des morceaux de planètes existantes afin de créer une nouvelle « superplanète ». Lorsque Clank partage cette information avec Ratchet, Ratchet accepte d'aider Clank à vaincre Drek, alimenté par le désir de toujours de partir à l'aventure interplanétaire pour suivre son idole, le capitaine Qwark. Volant de planète en planète, Ratchet et Clank construisent un incroyable arsenal d'armes dans l'espoir de rattraper et d'abattre Drek. Cependant, il découvre bientôt que Drek a l'intention de détruire la planète natale de Ratchet, Veldin. Ratchet et Clank arrêteront-ils Drek avant qu'il ne soit trop tard ?