Passado no ano de 2126, Lone Echo coloca os jogadores no papel de um andróide de serviço ECHO ONE apelidado de "Jack", a bordo da estação de mineração Kronos II em órbita de Saturno. Quando uma misteriosa anomalia espacial destrói alguns dos sistemas vitais da estação, Jack e a tripulante humana Olivia Rhodes trabalham juntos para reparar os danos e investigar o misterioso fenômeno.