Evreni birçok büyük tehlikeden kurtarmış olan cesur yıldızlararası kapıcı Roger Wilco, şimdi çok utanç verici bir durumda. Komutanları, cesur eylemlerine saygı duymuyor. Bunun yerine, galaktik yasaya karşı her türlü ihlalle suçlanıyor, sahip olduğu tüm onurlardan mahrum bırakılıyor ve merhamet göstergesi olarak eski işine - dolapları temizlemeye - dönmesine izin veriliyor... Ama o talihsiz olaylar... Roger'ın içine gireceği çok daha büyük sorunların sadece başlangıcı. Bir kez daha, galaksinin geleceği ona bağlı! Space Quest 6, StarCon Amiral'in yaşlı bir dul eşi olan Sharpei'nin sonsuza kadar yaşayacağı bir arsa etrafında dönüyor. Onun planı, daha genç bir bedenin çalınmasını ve bilincini ona yerleştirmeyi içeriyordu. Roger Wilco, kullanılacak beden olarak iradesi dışında bu komploya sürüklenir, ancak son anda arkadaşı ve eski sevgilisi Stellar Santiago tarafından kurtarılır. Roger'ı kurtarırken, Stellar muhtemelen bir patlamada öldü, ancak gerçekte Sharpei tarafından kaçırıldı ve yeni vücudu olarak kullanılıyor. Öldüğü varsayılan Stellar'dan bir imdat çağrısı alan Roger, onu bulmaya ve kurtarmaya kararlıdır.