Plankton vole la couronne du roi Neptune et la met au loin à Shell City. Lorsque M. Krabs est accusé de l'acte, Bob l'éponge et Patrick ont 6 jours pour recevoir la couronne de Neptune. Au cours de votre voyage en tant que Bob l'éponge ou Patrick, vous traversez des niveaux comme le Thug Tug et affrontez des ennemis et des boss comme le tueur à gages Dennis. C'est à vous de récupérer la couronne de Neptune, puis de rentrer chez vous sain et sauf à Bikini Bottom.