Im Jahr 2642 bleibt die Erde von außerirdischen Konflikten gezeichnet und 80 % der Weltbevölkerung wurden während der Entwicklung durch ein fehlerhaftes hypermagnetisches Waffennetz verwüstet. Bill Rizer, der Held der Alien Wars, wurde für den Vorfall verantwortlich gemacht und seinen Partner Lance Bean ermordet, der angeblich versucht hatte, ihn aufzuhalten. Bill wurde zu 10.000 Jahren Kryogefängnis verurteilt. Aber fünf Jahre später, 2647, wird die Erde plötzlich von einer Terrororganisation namens Blood Falcon bedroht, die von einem mysteriösen Kommandanten angeführt wird. Das Triumvirat, die regierende Regierung, lässt Bill frei, bevor er seine Strafe vollenden kann. Lucia, eine Soldatin und Cyborg, soll Bill Rizers Partnerin für seine Mission werden.