De 1995 à 2047, le monde a souffert d'un conflit continu alors que l'Initiative de défense mondiale (GDI) des Nations du G7 combat l'ordre religieux ténébreux de la Confrérie du Nod (NOD) sur une substance précieuse, mais toxique, qui se répand à travers le monde. monde, adaptant la planète à son environnement extraterrestre au fur et à mesure, Tiberium. Le chef de Nod, connu uniquement sous le nom de Kane, a façonné pendant des années l'avenir du monde pour couvrir complètement le monde en Tiberium et introduire l'humanité dans la prochaine étape de l'évolution humaine. Kane, marqué par la Confrérie comme "Le Messie", a mené Nod dans deux guerres du Tiberium contre GDI et deux fois GDI a détruit Kane et mis Nod à genoux, mais n'a pas pu les détruire. Après quarante ans de guerre, le monde est plongé dans le Tiberium, les conflits, la corruption et l'espoir. Le GDI commence enfin à combattre Tiberium, mais il y a des choses qui se cachent dans l'obscurité et qui attendent de sortir. Il est temps pour le GDI de reprendre ses armes pour se battre à nouveau, pour le monde.