Guybrush Threepwood è un aspirante pirata che è appena finito su un'isola dei Caraibi, chiamata Mêlée Island. Qui, apprende da tre vecchi pirati che ci sono tre cose da padroneggiare per essere un pirata: devi sapere come duellare, come trovare un tesoro e come rubare il bottino. Quindi, le prime missioni di Guybrush sono padroneggiare queste cose. Ad esempio, quando duelli con qualcuno, la tua abilità con la spada non è la cosa più importante, ma ciò che conta davvero sono le tue astuzie. Se insulti il tuo avversario e lui non risponde prontamente, ottieni il sopravvento. D'altra parte, se risponde prontamente, lui ottiene il sopravvento. Guybrush impara come duellare e trovare tesori e quando sta cercando di rubare una piccola statua alla residenza della governatrice, si imbatte nella governatrice, che si rivela essere una bellissima giovane donna di nome Elaine e Guybrush se ne innamora. Molto a sua disperazione, appena ha padroneggiato tutte e tre le sfide, Elaine viene rapita dal pirata fantasma LeChuck, che da quel momento in poi sarà l'arcinemico di Guybrush. Scopre che è stata portata nella misteriosa Monkey Island e da una sacerdotessa voodoo apprende che per arrivarci ha bisogno di una mappa, una nave e un equipaggio.