Após o colapso de uma superpotência no cenário mundial, implícita ser a União Soviética, várias facções surgiram e disputaram o controle de suas antigas áreas. Um deles foi a organização terrorista SKAR, que visa nada menos do que a conquista do mundo. No ano de 2006, um novo G.I. A equipe de Joe é criada para enfrentar SKAR e outras facções famintas de poder em uma guerra cada vez mais instável e devastada pela guerra.