7. sınıf öğrencisi Mikey Kudo, gizemli bir melodi duydu ve onu, Fusion Loader adlı gizemli, efsanevi Digivice'nin önünde belirdiği bir sokağa kadar takip etti. Arkadaşları Angie Hinomoto ve Jeremy Tsurugi eşliğinde Dijital Dünya'ya sürüklendiler. Kısa süre sonra Dijital Dünyanın Digimon adlı canlı yaratıkların yaşadığı bir yer olduğunu ve şimdi Bagra Ordusu adlı kötü bir imparatorluk tarafından yavaş yavaş ele geçirildiğini fark ettiler. Şimdi, Mikey ve "Fusion Fighters" ekibi, dünyayı İmparator Lord Bagra liderliğindeki Bagra Ordusu'ndan kurtarmak için önemli bir figür haline geldi.