Mavi Kelebekler dà un volto umano alla guerra nei Balcani e si concentra sul vero dolore del popolo bosniaco. Aida (Oya Okar) è una ragazza bosniaca intrappolata tra l'amore di un amico bosniaco (Murat) e un ex vicino e stretto nemico serbo (Marko). La sua guerra civile del 1992 e la Jugoslavia sono in pieno svolgimento.