Mavi Kelebekler coloca um rosto humano na guerra nos Bálcãs e se concentra na dor real do povo bósnio. Aida (Oya Okar) é uma garota bósnia presa entre o amor de um amigo bósnio (Murat) e um ex-vizinho e inimigo sérvio próximo (Marko). Sua guerra civil de 1992 e a Iugoslávia estão em pleno andamento.